MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 157973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019966	GTC	2	6	155675	155680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4002	NC_019966	GAT	2	6	155738	155743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645015
4003	NC_019966	CT	3	6	155783	155788	0 %	50 %	0 %	50 %	433645015
4004	NC_019966	CGA	2	6	155794	155799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4005	NC_019966	CAC	2	6	155801	155806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645015
4006	NC_019966	CAG	2	6	155852	155857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4007	NC_019966	GCGT	2	8	155876	155883	0 %	25 %	50 %	25 %	433645015
4008	NC_019966	TGA	2	6	155908	155913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645015
4009	NC_019966	CGT	2	6	155939	155944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4010	NC_019966	CAG	2	6	156065	156070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4011	NC_019966	CGA	2	6	156076	156081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4012	NC_019966	GCC	2	6	156089	156094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645015
4013	NC_019966	CG	3	6	156121	156126	0 %	0 %	50 %	50 %	433645015
4014	NC_019966	AGC	2	6	156151	156156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645015
4015	NC_019966	GCC	2	6	156173	156178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645015
4016	NC_019966	CATT	2	8	156337	156344	25 %	50 %	0 %	25 %	433645015
4017	NC_019966	CGG	2	6	156388	156393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645016
4018	NC_019966	GC	3	6	156481	156486	0 %	0 %	50 %	50 %	433645016
4019	NC_019966	ATC	2	6	156495	156500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645016
4020	NC_019966	CG	3	6	156747	156752	0 %	0 %	50 %	50 %	433645016
4021	NC_019966	GAC	2	6	156779	156784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645016
4022	NC_019966	ACG	2	6	156868	156873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645016
4023	NC_019966	CCG	2	6	157006	157011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645016
4024	NC_019966	GC	3	6	157024	157029	0 %	0 %	50 %	50 %	433645016
4025	NC_019966	AC	3	6	157065	157070	50 %	0 %	0 %	50 %	433645016
4026	NC_019966	CGG	2	6	157085	157090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645016
4027	NC_019966	CGTCT	2	10	157095	157104	0 %	40 %	20 %	40 %	433645016
4028	NC_019966	CGG	2	6	157106	157111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645016
4029	NC_019966	TTGGCG	2	12	157125	157136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433645016
4030	NC_019966	GCT	2	6	157148	157153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645016
4031	NC_019966	CGG	2	6	157274	157279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645016
4032	NC_019966	G	6	6	157338	157343	0 %	0 %	100 %	0 %	433645016
4033	NC_019966	GC	3	6	157390	157395	0 %	0 %	50 %	50 %	433645016
4034	NC_019966	GCG	2	6	157461	157466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4035	NC_019966	GCC	2	6	157468	157473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4036	NC_019966	CCA	2	6	157482	157487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645017
4037	NC_019966	CTC	2	6	157519	157524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645017
4038	NC_019966	CGC	2	6	157533	157538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4039	NC_019966	GC	3	6	157616	157621	0 %	0 %	50 %	50 %	433645017
4040	NC_019966	TGCG	2	8	157722	157729	0 %	25 %	50 %	25 %	433645017
4041	NC_019966	CG	4	8	157740	157747	0 %	0 %	50 %	50 %	433645017
4042	NC_019966	GCT	2	6	157752	157757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645017
4043	NC_019966	CGC	2	6	157791	157796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4044	NC_019966	CCA	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645017
4045	NC_019966	GCC	2	6	157828	157833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4046	NC_019966	GTC	2	6	157869	157874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645017
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4048	NC_019966	CTC	2	6	157903	157908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645017
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4050	NC_019966	TTC	2	6	157984	157989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645017
4051	NC_019966	CGC	2	6	158019	158024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4052	NC_019966	CGA	2	6	158031	158036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645017
4053	NC_019966	GCG	2	6	158049	158054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4054	NC_019966	CTC	2	6	158056	158061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645017
4055	NC_019966	GCC	2	6	158065	158070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4056	NC_019966	CGT	2	6	158073	158078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645017
4057	NC_019966	CGG	2	6	158136	158141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4058	NC_019966	GAC	2	6	158209	158214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645017
4059	NC_019966	CGG	2	6	158226	158231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4060	NC_019966	TCG	2	6	158234	158239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645017
4061	NC_019966	GCG	2	6	158240	158245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4062	NC_019966	GCG	2	6	158267	158272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645017
4063	NC_019966	GCC	2	6	158368	158373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4064	NC_019966	CGC	2	6	158376	158381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4065	NC_019966	CGC	2	6	158388	158393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645017
4066	NC_019966	GACCG	2	10	158398	158407	20 %	0 %	40 %	40 %	433645017
4067	NC_019966	GC	3	6	158510	158515	0 %	0 %	50 %	50 %	433645018
4068	NC_019966	GCT	2	6	158519	158524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645018
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4073	NC_019966	GC	3	6	158691	158696	0 %	0 %	50 %	50 %	433645018
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4075	NC_019966	GAC	2	6	158724	158729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645018
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4077	NC_019966	GC	4	8	158822	158829	0 %	0 %	50 %	50 %	433645018
4078	NC_019966	CGA	2	6	158831	158836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645018
4079	NC_019966	CCCGTG	2	12	158847	158858	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433645018
4080	NC_019966	GCA	2	6	158864	158869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645018
4081	NC_019966	GACG	2	8	158937	158944	25 %	0 %	50 %	25 %	433645018
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4087	NC_019966	CGT	2	6	159329	159334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645018
4088	NC_019966	GAC	2	6	159339	159344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645018
4089	NC_019966	TCA	2	6	159379	159384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645018
4090	NC_019966	GAG	2	6	159441	159446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433645018
4091	NC_019966	CAC	2	6	159447	159452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645018
4092	NC_019966	GGC	2	6	159460	159465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645018
4093	NC_019966	CCA	2	6	159541	159546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645018
4094	NC_019966	ACC	2	6	159567	159572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645018
4095	NC_019966	GCG	2	6	159577	159582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645018
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4099	NC_019966	GTC	2	6	159780	159785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645018
4100	NC_019966	TC	3	6	159804	159809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_019966	CGG	2	6	159820	159825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645019
4102	NC_019966	GCA	2	6	159841	159846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645019
4103	NC_019966	GC	3	6	159847	159852	0 %	0 %	50 %	50 %	433645019
4104	NC_019966	GAA	2	6	159863	159868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433645019
4105	NC_019966	CGACCT	2	12	159928	159939	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433645019
4106	NC_019966	CGG	2	6	159952	159957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645019
4107	NC_019966	TCG	2	6	159987	159992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645019
4108	NC_019966	ACCC	2	8	160016	160023	25 %	0 %	0 %	75 %	433645019
4109	NC_019966	AGGC	2	8	160024	160031	25 %	0 %	50 %	25 %	433645019
4110	NC_019966	CGCGC	2	10	160051	160060	0 %	0 %	40 %	60 %	433645019
4111	NC_019966	CCG	2	6	160086	160091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645019
4112	NC_019966	TGCC	2	8	160158	160165	0 %	25 %	25 %	50 %	433645019
4113	NC_019966	GTC	2	6	160175	160180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645019
4114	NC_019966	CG	3	6	160231	160236	0 %	0 %	50 %	50 %	433645019
4115	NC_019966	CGC	2	6	160250	160255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645019
4116	NC_019966	CCG	2	6	160281	160286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645019
4117	NC_019966	CGAC	2	8	160306	160313	25 %	0 %	25 %	50 %	433645019
4118	NC_019966	GCG	2	6	160357	160362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645019
4119	NC_019966	CGC	2	6	160480	160485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645019
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4121	NC_019966	GCC	2	6	160597	160602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645019
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4233	NC_019966	ACG	2	6	165297	165302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645022
4234	NC_019966	AC	3	6	165323	165328	50 %	0 %	0 %	50 %	433645022
4235	NC_019966	CAG	2	6	165352	165357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645022
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4237	NC_019966	CCCG	2	8	165373	165380	0 %	0 %	25 %	75 %	433645022
4238	NC_019966	CTG	2	6	165384	165389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645022
4239	NC_019966	GTT	2	6	165394	165399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433645022
4240	NC_019966	GCCCG	2	10	165460	165469	0 %	0 %	40 %	60 %	433645022
4241	NC_019966	TCG	2	6	165654	165659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645022
4242	NC_019966	CGC	2	6	165665	165670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645022
4243	NC_019966	TCG	2	6	165699	165704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645022
4244	NC_019966	CG	3	6	165757	165762	0 %	0 %	50 %	50 %	433645023
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4332	NC_019966	CGT	2	6	169081	169086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645025
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4339	NC_019966	CATC	2	8	169282	169289	25 %	25 %	0 %	50 %	433645025
4340	NC_019966	GCA	2	6	169291	169296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645025
4341	NC_019966	GCC	2	6	169298	169303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645025
4342	NC_019966	CAG	2	6	169319	169324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645025
4343	NC_019966	CCGG	2	8	169332	169339	0 %	0 %	50 %	50 %	433645025
4344	NC_019966	CG	4	8	169408	169415	0 %	0 %	50 %	50 %	433645025
4345	NC_019966	GGCCGG	2	12	169521	169532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4346	NC_019966	CCGC	2	8	169552	169559	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4347	NC_019966	CCG	2	6	169566	169571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4348	NC_019966	CGG	2	6	169586	169591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645026
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4350	NC_019966	TCA	2	6	169661	169666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645026
4351	NC_019966	GAA	2	6	169686	169691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433645026
4352	NC_019966	CGG	2	6	169703	169708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645026
4353	NC_019966	GGTG	2	8	169764	169771	0 %	25 %	75 %	0 %	433645026
4354	NC_019966	CGG	2	6	169785	169790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645026
4355	NC_019966	GCGG	2	8	169924	169931	0 %	0 %	75 %	25 %	433645026
4356	NC_019966	TCG	2	6	169961	169966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645026
4357	NC_019966	CGG	3	9	170019	170027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645026
4358	NC_019966	G	6	6	170026	170031	0 %	0 %	100 %	0 %	433645026
4359	NC_019966	CTG	2	6	170032	170037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645026
4360	NC_019966	GCG	2	6	170155	170160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645026
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4362	NC_019966	CAG	2	6	170307	170312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645026
4363	NC_019966	ACG	2	6	170315	170320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645026
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4365	NC_019966	CG	3	6	170391	170396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4366	NC_019966	CGA	2	6	170422	170427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645027
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4388	NC_019966	GTC	2	6	171111	171116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4476	NC_019966	GCG	4	12	175172	175183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645033
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4479	NC_019966	GC	3	6	175281	175286	0 %	0 %	50 %	50 %	433645033
4480	NC_019966	TCG	2	6	175304	175309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645033
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4482	NC_019966	GCA	2	6	175338	175343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645033
4483	NC_019966	CGG	2	6	175427	175432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4484	NC_019966	GGC	2	6	175439	175444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645034
4485	NC_019966	GTG	2	6	175459	175464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645034
4486	NC_019966	CG	3	6	175528	175533	0 %	0 %	50 %	50 %	433645034
4487	NC_019966	CGGC	2	8	175542	175549	0 %	0 %	50 %	50 %	433645034
4488	NC_019966	AC	4	8	175615	175622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4489	NC_019966	CAAT	2	8	175626	175633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4490	NC_019966	CA	3	6	175645	175650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4491	NC_019966	GCA	2	6	175652	175657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_019966	CAG	2	6	175665	175670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4493	NC_019966	GGC	2	6	175779	175784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_019966	GCT	2	6	175872	175877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645035
4495	NC_019966	GC	3	6	175921	175926	0 %	0 %	50 %	50 %	433645035
4496	NC_019966	CGG	2	6	175940	175945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645035
4497	NC_019966	CGA	2	6	175954	175959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645035
4498	NC_019966	CGTGC	2	10	175967	175976	0 %	20 %	40 %	40 %	433645035
4499	NC_019966	CGGT	2	8	176047	176054	0 %	25 %	50 %	25 %	433645035
4500	NC_019966	AGGCA	2	10	176083	176092	40 %	0 %	40 %	20 %	433645036

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